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近日,中国科学院植物研究所研究员秦国政、副研究员周磊磊等揭示了RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟的机制。相关成果发表于Nature Plants,期刊同期在Research Briefing栏目发表研究简报,对该成果进行了推荐。
活性氧作为重要的信号分子,在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫,以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要调控作用。在多种活性氧分子中,过氧化氢(H2O2)具有较长的半衰期,可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程,受到了广泛关注,但是它如何与其他信号途径协同作用,共同调控植物发育过程却仍不清楚。
研究人员以番茄果实为研究对象,发现H2O2可引起m6A RNA去甲基化酶SlALKBH2发生氧化修饰形成同源二聚体,促进SlALKBH2蛋白稳定,保障其在果实成熟过程中发挥功能,从而揭示了H2O2信号协同m6A修饰调控果实成熟的新机制。
m6A RNA甲基化修饰广泛存在于真核生物的mRNA分子上,参与调控多个生物学途径。在该研究中,研究人员首先推测,前期工作中鉴定到的m6A去甲基化酶SlALKBH2作为双加氧酶,自身可能存在氧化还原修饰。为了验证这一假设,科研人员将SlALKBH2编码基因在烟草中瞬时表达并用H2O2进行处理,结果显示SlALKBH2对H2O2敏感,在氧化条件下通过分子间二硫键形成同源二聚体。在番茄果实成熟过程中,同样观察到SlALKBH2形成同源二聚体的现象,且H2O2处理进一步增强二聚体形成。此外,H2O2处理可加速番茄果实成熟进程,而这种现象在slalkbh2突变体材料中显著减弱,说明SlALKBH2氧化修饰参与了H2O2诱导的果实成熟调控。
为了鉴定在同源二聚体形成过程中发挥关键作用的半胱氨酸,研究人员对SlALKBH2分子中的10个半胱氨酸进行了单点或组合突变,发现第39位半胱氨酸对同源二聚体的形成至关重要。进一步分析表明,氧化修饰使SlALKBH2蛋白质更加稳定,但是不影响其去甲基化酶活性。研究人员进一步对SlALKBH2的互作蛋白进行了筛选和鉴定并发现硫氧还蛋白还原酶SlNTRC与SlALKBH2发生相互作用。SlNTRC能够调控SlALKBH2的氧化还原状态,进而影响SlALKBH2的蛋白质稳定性和生物学功能。
这项研究建立了活性氧信号与表观转录组之间的内在联系,不仅增进了对植物发育和果实成熟分子机制的理解,而且为利用基因编辑技术改良作物品种提供了新的策略和方法。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1038/s41477-024-01893-8
https://doi.org/10.1038/s41477-024-01900-y
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