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首个人参完整基因组发布
科学网  2024-05-11 11:55:07  

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记者6日从中国农业科学院获悉,该院深圳农业基因组研究所农业生物转录组与代谢组创新团队发表了首个人参端粒到端粒完整基因组,解析了人参重要活性成分——三萜皂苷的形成机制。相关研究成果日前发表于国际期刊《园艺研究》上。

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论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员李伟告诉记者,人参属于遗传背景极其复杂的异源四倍体。研究团队综合应用多种测序技术,成功构建了完整性高达99.3%的人参全基因组,其大小为3.45Gb。此外,研究人员还精确鉴定了48个端粒,并预测了24个着丝粒,这一成果显著提高了人参基因组的连续性、完整性和精确度。

基于已构建的高完整性人参基因组,研究人员对人参三萜皂苷合成基因在异源四倍体形成过程中的不平衡进化进行了深入探索。研究发现,串联重复和近端重复在人参三萜皂苷的生物合成过程中扮演了至关重要的角色。同时,研究还发现,在人参中有一个亚基因组的基因比另一个亚基因组的基因更为活跃,存在亚基因组优势现象。

“该研究为人参的遗传研究、育种规划以及人参三萜皂苷的生物合成路径提供了资源。此外,还为筛选优质人参种质资源以及三萜皂苷的生物合成奠定了理论基础。”李伟说。

(中国农业科学院深圳农业基因组研究所供图)

 
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